Compete à ARS Algarve coordenar e avaliar a execução da política de saúde na região, de acordo com as políticas globais e sectoriais do Governo no domínio da saúde.

Tem, ainda, como funções:

As suas competências abrangem os serviços públicos em todas as suas vertentes e os prestadores de cuidados de saúde, privados ou sociais, integrados no sistema nacional de saúde, existentes no Algarve.